El primer equip de futbol de la Seu d’Urgell va ser el Futbol Club Valira (o Balira). Va ser fundat el 1914 pel Mariano Obach. El seu primer partit va ser davant el FC Ceretano (actual Puigcerdà) amb un resultat de 3 a 2 a favor dels de la Seu. Els seus colors eren el verd i el vermell i el seu primer camp era el de cal Toni Pal o del Jardín, atès que es trobava molt a prop d’aquell bordell, just al costat de l’actual terreny de joc. 
Tenim una menció al diari La Jornada Deportiva del 24 de juliol de 1922 en que diu: “Orgañá FC 3 – FC Balira 1. Partido muy competido, presenciada por un público numeroso y entusiasta”.
En aquest article que vam publicar es narra amb pèls i senyals un altre partit el 1922. https://www.cforganya.cat/category/historia-2/page/34/
Cap el 1924, amb la intenció d’unir a tots els grups esportius existents a la ciutat es va formar el Club Unión Deportiva Urgelense. En època de la República el trobem esmentat com Unió Sportiva Urgellenca. Després de la guerra es va tornar a dir UD Urgelense fins que el 1954 se’l rebatejaria com a Unión Deportiva Seo de Urgel (UDSU). Des de 1986 el seu nom oficial és La Seu d’Urgell FC.
Els anys 1956-57 i 1957-58 va jugar a Tercera divisió, la màxima categoria mai assolida. A finals de la dècada dels seixanta el futbol es traslladà de manera provisional al camp del Codina, al costat de la Salle i a finals dels setanta es van estrenar les instal·lacions del Camp Municipal d’Esports, equipat amb una tribuna coberta. El 2017, després de la mort de l’exjugador i entrenador de la Seu Emili Vicente, el camp va ser batejat amb el seu nom.
La rivalitat entre la Seu i l’Organyà sempre ha estat ben present. Alguns partits que hem trobat a la premsa són un de 1931: US Urgellenca – SC Organyà 1-2 i un de 1932: US Urgellenca – SC Organyà 1-4, tots dos de la revista CADÍ i dels quals ja en vam parlar en aquest article. https://www.cforganya.cat/wp-admin/post.php?post=3087&action=edit
El 1933 hem trobat referències de la Copa Alt Pirineu entre la Unió Urgellenca, Joventut d’Esquerra Republicana (de la Seu), Organyà i Puigcerdà.
El 1952 tenim notícia del Torneig Alt Pirineu amb l’Organyà, Andorra, Bellver, Nargonense, Prullans, Puigcerdà i Urgelense. 
El 1957 ens vam tornar a trobar al Torneig de Primavera entre Organyà, Nargonense, Andorra, Ceretano (Puigcerdà), Oliana, Seu d’Urgell i Bellver. El 2 de juny de 1957 el resultat va ser Organyà 2 – La Seu 7.
D’aquests tornejos no tenim cap dada més, ni classificacions, ni partits, res de res.
Parlar de futbol a la Seu significa també parlar de la presència de soldats en les alineacions. En algunes ocasions, la pràctica totalitat dels convocats eren soldats. Aquest fou el motiu pel qual alguns joves fundaren a principis dels anys cinquanta un altre equip, la Peña Urgelense, format íntegrament per urgellencs. L’existència d’aquest club fou efímera. Tot i els seus bons resultats, hagueren de desaparèixer perquè no tenien fitxes federatives.
Anys abans , durant la Segona República, la ciutat va tenir altres equips de futbol oficials. El Casal d’Esquerra impulsà el 1931 la Joventut Republicana. En aquella època, els militars de la Seu tenien dos equips propis, el FC Infantería i el Montaña n.5 SC.
Als anys 70 – 80 la Penya Barcelonista de la Seu també tenia el seu propi club de futbol amb qui vam coincidir la temporada 1973-74 a tercera regional. A la Seu vam guanyar 3 a 4 i a les Lloredes 5 a 0.
Entre 2005 i 2011 va jugar entre segona i tercera regional el CF Castellciutat amb qui no vam coincidir mai.
El 1996 es va crear l’Escola de Futbol Orgèl·lia (Edfor) i el 2016 els nostres amics del Club Esportiu Ciutat la Seu. Amb els dos equips hi vam coincidir per primera vegada la temporada 2019-2020, l’any del Covid, temporada que no es va poder acabar.
Partits de futbol base contra equips de la Seu:
| 2019-2020 | Alevins | Edfor C | Organyà | 1-4 | Joseph 2, Jesús, Arnau |
| 2019-2020 | Alevins | Organyà | Ciutat la Seu | 4-2 | Jesús, Arnau 3 |
| 2021-2022 | Infantils | Edfor B | Organyà | 4-0 | |
| 2021-2022 | Infantils | Organyà | Edfor B | 1-4 | Antonio David |
| 2023-2024 | Cadets | Organyà | Edfor B | 2-3 | Jan, Amir |
| 2023-2024 | Cadets | Edfor B | Organyà | 3-3 | Fabio 2, Jesús |
Partits entre els primers equips de ganxos i urgellencs en els últims 50 anys:
| 1976 | Playoff | Organyà | La Seu | 2-1 | |
| 1976 | Playoff | La Seu | Organyà | 1-0 | |
| 1981-1982 | 2a regional | La Seu | Organyà | 3-1 | |
| 1981-1982 | 2a regional | Organyà | La Seu | 0-0 | |
| 1997-1998 | 2a regional | La Seu | Organyà | 2-1 | Enric |
| 1997-1998 | 2a regional | Organyà | La Seu | 2-1 | Escofet, Ramon |
| 2003-2004 | 1a regional | Organyà | La Seu | 2-0 | Robert, Guiu |
| 2003-2004 | 1a regional | La Seu | Organyà | 0-3 | Miki, Robert, Solé |
| 2007-2008 | 1a regional | La Seu | Organyà | 2-2 | Gual, Alberto |
| 2007-2008 | 1a regional | Organyà | La Seu | 3-2 | Ramon 2, Gual |
| 2009-2010 | 1a regional | La Seu | Organyà | 0-1 | Robert |
| 2009-2010 | 1a regional | Organyà | La Seu | 1-1 | Jordi pp |
| 2011-2012 | 2a catalana | Organyà | La Seu | 0-3 | |
| 2011-2012 | 2a catalana | La Seu | Organyà | 1-0 | |
| 2012-2013 | 2a catalana | Organyà | La Seu | 3-1 | Ordóñez, Nourddin, Ramon |
| 2012-2013 | 2a catalana | La Seu | Organyà | 3-3 | Ramon, Pau, Jesús Cases |
| 2013-2014 | 2a catalana | La Seu | Organyà | 2-2 | Ramon 2 |
| 2013-2014 | 2a catalana | Organyà | La Seu | 1-2 | Ordóñez |
| 2014-2015 | 2a catalana | Organyà | La Seu | 3-0 | Robert, Òscar, Pau |
| 2014-2015 | 2a catalana | La Seu | Organyà | 1-2 | Pau, Òscar |
| 2019-2020 | 3a catalana | Organyà | La Seu | 3-0 | Jaume, Pol, Cheikh |
| 2019-2020 | 3a catalana | La Seu | Organyà | 1-3 | Casanova, Cheikh, Robert |
| 2021-2022 | 2a catalana | La Seu | Organyà | 2-0 | |
| 2021-2022 | 2a catalana | Organyà | La Seu | 0-1 | |
| 2022-2023 | 2a catalana | La Seu | Organyà | 1-2 | Cristian, Diego |
| 2022-2023 | 2a catalana | Organyà | La Seu | 0-0 | |
| 2023 | Playoff | Organyà | La Seu | 4-1 | Casanova 3, Paulo |
| 2023 | Playoff | La Seu | Organyà | 0-1 | Cristian |
| PJ | PG | PE | PP | GF | GC | |
| A casa | 14 | 8 | 3 | 3 | 24 | 13 |
| A la Seu | 14 | 6 | 3 | 5 | 21 | 19 |
| Total | 28 | 14 | 6 | 8 | 45 | 32 |
| Copa Pirineus | ||||
| 2017 | La Seu | Organyà | 0-0 | |
| 2018 | La Seu | Organyà | 1-1 | |
| 2019 | Organyà | La Seu | 3-2 | Jaume, Robert, Casanova |
| 2022 | Organyà | La Seu | 1-1 | Robert |
| 2024 | La Seu | Organyà | 1-0 | |
| 2024 | Organyà | La Seu | 3-2 | Cristian, Feliu, Blanco |